Créditos ECTS Créditos ECTS: 4.5
Horas ECTS Criterios/Memorias Traballo do Alumno/a ECTS: 74.25 Horas de Titorías: 2.25 Clase Expositiva: 18 Clase Interactiva: 18 Total: 112.5
Linguas de docencia Castelán (100%)
Tipo: Materia Ordinaria Grao RD 1393/2007 - 822/2021
Departamentos: Bioquímica e Bioloxía Molecular, Química Orgánica
Áreas: Bioquímica e Bioloxía Molecular, Química Orgánica
Centro Facultade de Bioloxía
Convocatoria: Segundo semestre
Docencia: Sen docencia (Extinguida)
Matrícula: Non matriculable
- Enumerar as estratexias e métodos máis comúns en enxeñería de proteínas.
- Identificar as aplicacións prácticas da enxeñería de proteínas en biotecnoloxía.
- Distinguir os métodos de representar as estruturas de biomoléculas e saber utilizar o software para a súa análise.
- Identificar os factores que inflúen no plegamiento de proteínas.
Contidos
As clases, tanto temáticas como seminarios serán en xeral presenciai,. Excepcionalmente e previa notificación ao alumnado, as tutorías poderán ser híbridos (aula e MS Teams) ou totalmente virtuais (plataforma MS Teams).
Clases Expositivas
- Introdución. Aplicacións da enxeñería de proteínas: industria alimentaria, deterxentes, aplicacións ambientais, aplicacións médicas, biopolímeros, aplicacións nanobiotecnológicas.
- Plegamiento de proteínas: Termodinámica e cinética de plegamiento. Pregamiento in vivo.
- Deseño e síntese de proteínas de novo: Métodos racionais, incorporación de aminoácidos non naturais, ensamblaxe de estruturas terciarias a partir de elementos de estrutura secundaria, etc. Bioconxugación.
- Casos representativos de proteínas modificadas. Proteasas resistentes á oxidación, Insulinas, TPA, GFPs, FDH, etc.
Seminarios
- Análise de casos reales en deseño de péptidos e proteínas con diversas aplicacións.
Aula de informática
- Ao longo das dúas prácticas informáticas abordarase o uso de programas representativos utilizados para a representación e estudo de estruturas de biomoléculas. Uso do programa UCSF Chimera (https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/) e/ou PyMol (https://pymol.org/2/). Uso de bases de datos estruturais (PDB, https://www.rcsb.org/).
- Tamén se presentarán diversas ferramentas en liña, como o servidor AGADIR (http://agadir.crg.es/), SeqOPT (http://mml.spbstu.ru/services/seqopt/) e o portal ROSIE (https://rosie.graylab.jhu.edu/).
Titorías de grupo
- Reforzo dos contidos da materia mediante a resolución de problemas plantexados polo alumnado, exposición ou debate de temas relacionados coa materia no contexto da biotecnoloxía.
Basica
- V. Köhler (Ed.) Protein Design, Metods and Applications in Methods in Molecular Biology, 2014 Humana Press.
- K. J. Jensen (Ed.). Peptide and Protein Design for Biopharmaceutical Applications, 2009 John Wiley & Sons.
Complementaria
- E Buxbaum, Fundamentals of Protein Structure and Function, 2007 Springer.
- C. Köhrer, U. L. RajBhandary (Eds.). Protein Engineering in Nucleic Acids and Molecular Biology series no. 22, 2009, Springer.
- P. Kaumaya, Protein Engineering, 2012, InTech.
Básicas e Xenerais
CG1 - Coñecer os conceptos, métodos e resultados máis importantes das distintas ramas da Biotecnoloxía.
CG2 - Aplicar os coñecementos teóricos-prácticos adquiridos na formulación de problemas e a procura das súas solucións tanto en contextos académicos como profesionais.
CG3 - Saber obter e interpretar información e resultados relevantes e obter conclusións en temas relacionados coa Biotecnoloxía.
CG4 - Ser capaces de transmitir información tanto por escrito como de forma oral e de debater ideas, problemas e solucións relativos á Biotecnoloxía, #ante un público xeral ou especializado.
CG5 - Estudar e aprender de forma autónoma, con organización de tempo e recursos, novos coñecementos e técnicas en Biotecnoloxía e adquirir capacidade para traballar en equipo.
CB1 - Que os estudantes demostrasen posuír e comprender coñecementos nunha área de estudo que parte da base da educación secundaria xeral, e adóitase atopar a un nivel que, aínda que se apoia en libros de texto avanzados, inclúe tamén algúns aspectos que implican coñecementos procedentes da vangarda do seu campo de estudo
CB2 - Que os estudantes saiban aplicar os seus coñecementos ao seu traballo ou vocación dunha forma profesional e posúan as competencias que adoitan demostrarse por medio da elaboración e defensa de argumentos e a resolución de problemas dentro da súa área de estudo
CB3 - Que os estudantes teñan a capacidade de reunir e interpretar datos relevantes (normalmente dentro da súa área de estudo) para emitir xuízos que inclúan unha reflexión sobre temas relevantes de índole social, científica ou ética
CB4 - Que os estudantes poidan transmitir información, ideas, problemas e solucións a un público tanto especializado como non especializado
CB5 - Que os estudantes desenvolvesen aquelas habilidades de aprendizaxe necesarias para emprender estudos posteriores cun alto grao de autonomía.
Transversais
CT1 - Pensar de forma integrada e abordar os problemas desde diferentes perspectivas.
CT2 - Buscar, procesar, analizar e sintetizar información procedente de diversas fontes.
CT3 - Organizar e planificar o seu traballo.
CT4 - Interpretar resultados experimentais e identificar elementos consistentes e inconsistentes.
CT7 - Manter un compromiso ético.
CT6 - Razoar críticamente.
Específicas
CE2 - Comprender e saber aplicar vos principios físico-químicos dos procesos biolóxicos con aplicación en Biotecnoloxía, así como as principais ferramentas utilizadas para investigalos.
CE3 - Coñecer e saber aplicar as técnicas instrumentais e os protocolos de traballo nun laboratorio, aplicando as normativas e técnicas relacionadas con seguridade e hixiene, xestión de residuos e calidade.
- A docencia expositiva e interactiva (incluidas as prácticas de informática) será presencial. Excepcionalmente, a docencia presencial poderase combinar coa docencia virtual ata un máximo do 10% das horas totales da materia e no caso da docencia práctica realizada mediante medios telemáticos podería chegar ao 25%.
- Clases expositivas. O profesor desenvolverá o contido do programa facendo uso de exercicios e exemplos prácticos que ilustren os conceptos explicados. Combinaranse as explicacións con materiais da bibliografía, así como de referencias de revistas científicas.
- Seminarios e Titorías en grupo. Se analizarán casos reais de deseño de péptidos e proteínas. Incentivarase que os alumnos participen activamente nos seminarios ao longo do todo o curso, sendo esta participación uno dos criterios de avaliación. Exporanse problemas para que o estudante tente resolvelos de forma autónoma, entregando a súa solución ao profesorado con antelación ás clases de seminario en que se resolverán. Nas estas clases, os alumnos exporán as súas solucións, encargándose o profesor de resolver as dúbidas e dificultades que se expoñan. Ocasionalmente, nos seminarios tamén se proporán exercicios breves para resolver no momento, que se terán en conta na avaliación.
- Titorías individuais. As tutorías serán fundamentalmente de carácter presencial, si ben poderán realizarse parcialmente de maneira virtual. Farase un seguemento máis próximo ao traballo do alumno, reforzando a docencia oficial con titorías persoais segundo as necesidades de cada estudante.
- Clases prácticas na aula de informática. Dúas sesións nas que os estudantes poderán familiarizarse con diversas ferramentas utilizadas para a representación estrutural de biomoléculas, as bases de datos máis relevantes, así como algún software para o deseño de proteínas. As prácticas de informática poderán ser en modalidade virtual, en todo caso cun máximo do 25% das horas prácticas da materia.
- Aula virtual (Moodle). A materia contará cunha aula virtual na que se incluirá todo o material de apoio docente do curso, os calendarios, ligazóns a páxinas de interese, etc. Esta plataforma tamén contén foros de discusión e correo interno o que proporciona unha excelente comunicación entre profesores e estudantes.
A cualificación global do estudante na materia resultará de facer unha media ponderado entre as cualificacións obtidas polo seu rendemento no exame final (70%), e a nota derivada da avaliación continua do traballo nos seminarios e titorías (30%). Estes mesmos instrumentos serán utilizados para avaliar as competencias da materia, con particular énfase nas competencias específicas da materia.
O exame constará de preguntas curtas e exercicios nos que se aplicarán os conceptos de deseño de proteínas explicados durante a materia.
A avaliación continua realizarase combinando actividades presenciais, tales como exposicións ou resolución de cuestións en clase, con actividades online empregando os recursos das plataformas institucionais (Aula Virtual-Moodle e Microsoft Teams.
Para os casos de realización fraudulenta de exercicios ou probas será de aplicación o recolleito na “Normativa de avaliación do rendemento académico dous estudantes e de revisión de *cualificacións” que se pode consultar na seguinte ligazón: https://bit.ly/3btFiUI.
Traballo persoal, 72 h
É importante destacar que o traballo persoal do alumno ten que ser continuado ao longo da materia, pois se trata dunha materia na que os contidos que se imparten a medida que avanza o programa fundaméntanse nos coñecementos adquiridos nos temas previos.
Jose Manuel Martinez Costas
- Departamento
- Bioquímica e Bioloxía Molecular
- Área
- Bioquímica e Bioloxía Molecular
- Teléfono
- 881815734
- Correo electrónico
- jose.martinez.costas [at] usc.es
- Categoría
- Profesor/a: Catedrático/a de Universidade
Marco Eugenio Vazquez Sentis
- Departamento
- Química Orgánica
- Área
- Química Orgánica
- Teléfono
- 881815738
- Correo electrónico
- eugenio.vazquez [at] usc.es
- Categoría
- Profesor/a: Catedrático/a de Universidade
Maria Valentina Malave Fernandez
- Departamento
- Química Orgánica
- Área
- Química Orgánica
- Correo electrónico
- mariav.malave [at] usc.es
- Categoría
- Predoutoral Xunta
Daniel Abella López
- Departamento
- Bioquímica e Bioloxía Molecular
- Área
- Bioquímica e Bioloxía Molecular
- Correo electrónico
- daniel.abella.lopez [at] usc.es
- Categoría
- Predoutoral Ministerio
Adrián López Teijeiro
- Departamento
- Bioquímica e Bioloxía Molecular
- Área
- Bioquímica e Bioloxía Molecular
- Correo electrónico
- adrianlopez.teijeiro [at] usc.es
- Categoría
- Predoutoral Ministerio
Paula Sánchez Gascón
- Departamento
- Bioquímica e Bioloxía Molecular
- Área
- Bioquímica e Bioloxía Molecular
- Correo electrónico
- paulasanchez.gascon [at] usc.es
- Categoría
- Predoutoral USC
| Luns | ||
|---|---|---|
| 09:00-10:00 | Grupo /CLE_01 | Aula 08. Louis Pasteur |
| Martes | ||
| 09:00-10:00 | Grupo /CLE_01 | Aula 08. Louis Pasteur |
| 24.05.2024 10:00-14:00 | Grupo /CLE_01 | Aula 04: James Watson e Francis Crick |
| 05.07.2024 10:00-14:00 | Grupo /CLE_01 | Aula 03. Carl Linneo |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| Abella López, Daniel | Castelán |
| López Teijeiro, Adrián | Castelán |
| MALAVE FERNANDEZ, MARIA VALENTINA | Castelán |
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| Sánchez Gascón, Paula | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| Abella López, Daniel | Castelán |
| López Teijeiro, Adrián | Castelán |
| MALAVE FERNANDEZ, MARIA VALENTINA | Castelán |
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| Sánchez Gascón, Paula | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| Abella López, Daniel | Castelán |
| López Teijeiro, Adrián | Castelán |
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| Sánchez Gascón, Paula | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |
| Docente | Idioma |
|---|---|
| MARTINEZ COSTAS, JOSE MANUEL | Castelán |
| VAZQUEZ SENTIS, MARCO EUGENIO | Castelán |